Trường Đại học Y Dược Cần Thơ có sứ mạng đào tạo nguồn nhân lực y tế trình độ đại học và sau đại học; nghiên cứu khoa học, ứng dụng và chuyển giao công nghệ; bảo vệ và nâng cao sức khỏe cho nhân dân vùng Đồng bằng sông Cửu Long và cả nước.