TT DN-GDTX Phú Tân hoạt động từ năm 1998, với nhiệm vụ tư vấn hướng nghiệp cho học sinh THPT góp phần phân luồng học sinh ở các bậc học tiếp theo, phù hợp với năng lực, sở trường của học sinh, nhu cầu của xã hội. Trung tâm thường xuyên lồng ghép hoạt động hướng nghiệp vào giờ dạy trên lớp cho học sinh. Hoạt động hướng nghiệp giúp học sinh biết cách tìm hiểu thế giới nghề nghiệp, nhu cầu xã hội, năng lực bản thân để lựa chọn hướng đi cho bản thân sau khi tốt nghiệp THPT.